SDN 1 Kalirejo berdiri pada tahun 1953 diatas tanah seluas 1820 m2. Tanah tersebut berasal dari wakaf penduduk desa Kalirejo. Dalam perkembangannya pada tahun 1986 siswa yang masuk di SDN 1 Kalirejo bertambah banyak sehingga kelas yang ada yaitu hanya tiga kelas tidak mencukupi. Melalui keputusan bersama maka warga desa lewat Kepala Desa Kalirejo waktu itu yaitu bapak Mohammad Yasin (alm) memungut iuran kepada warga ditambah kas desa untuk membeli tanah guna pembangunan ruang kelas baru. Karena pada waktu itu dana yang dikumpulkan terbatas maka hanya dapat membeli tanah murah yang letaknya jauh dari unit utama.
Sejak tahun 1990 SDN 1 Kalirejo sudah dapat berkembang menjadi SD senter di kecamatan Kabat. Hingga tahun 2009 output SDN 1 Kalirejo lewat tolok ukur danem selelu menempati peringkat satu atau dua di kecamatan Kabat. Pada tahun 2007 – 2008 SDN 1 Kalirejo sudah mampu menggunakan kurikulum tingkat satuan pelajaran yang didalamnya terdapat Program Pendidikan Umum dan Program Pendidikan kurikuler yang secara umum berusaha meningkatkan mutu Pendidikan dan meningkatkan kemampuan Sumber Daya Manusia (SDM).